Преди влизане в сила на плановете са постигнати целите за добро екологично състояние за 46% от повърхностните водни тела, а по отношение на химичното състояние – за 34% от тях. С прилагането на програмата от мерки в ПУРБ за периода 2016-2021 г. се цели до 90% от повърхностните води да бъдат в добро екологично състояние.
Министерството провежда последователна политика за намаляване на въздействията на човешката дейност и ограничаване на замърсяванията от нея. В България има 264 водноелектрически централи (ВЕЦ). Още в ранен етап 246 инвестиционни намерения за ВЕЦ са оценени като недопустими и затова не са реализирани. От влизане в сила на ПУРБ за 2016-2021 г. са отнети 20 разрешителни за водовземане. Издадени са 42 решения за отказ за продължаване срока на действие и/или изменение на разрешителни и 7 решения за прекратяване на действието на разрешителни. От 2016 г. досега при контрол на дейността на ВЕЦ от басейновите дирекции са издадени 67 наказателни постановления за нарушение на Закона за водите.
Създадена е междуведомствена работна група, която подготвя наредба за условията, реда и техническите изисквания за изграждане на рибни проходи. Нормативният документ се разработва в съответствие с изискванията на Закона за рибарството и аквакултурите и ще бъде готов през май. Тази наредба цели да осигури свободната миграция на рибите и другите водни организми и непрекъсваемост на водния отток.